Adenine en Uracil Bond: wat, hoe, gedetailleerde feiten

De Adenine- en Uracil-binding is een van de meest significante bindingen die aanwezig zijn in RNA. Hier gaan we elk mogelijk aspect met betrekking tot de adenine- en Uracil-binding bespreken.

Adenine (A) een purinebase en Uracil (U) een pyrimidinebase, beide maken complementaire basenparen in een RNA-structuur door waterstofhoudende dubbele bindingen daartussen te vormen, deze binding staat bekend als Adenine- en Uracil-binding.

De adenine- en Uracil-binding is alleen aanwezig in de RNA-structuur. Het DNA bevat geen uracil als pyrimidinebase, in plaats daarvan heeft DNA zijn gemethyleerde versie Thymine, daarom is de binding van Adenine en Uracil afwezig in DNA. Tijdens bindingsvorming kan Uracil (U) zowel als waterstofbindingacceptor als donor in RNA fungeren. 

Wat is adenine- en uracil-binding?

Adenine- en Uracil-binding is een waterstofbinding tussen de twee nucleobasen.

Adenine en Uracil zijn beide complementair aan elkaar en maken waterstofachtige dubbele bindingen daartussen en stabiliseren een RNA-structuur. Deze waterstofhoudende dubbele binding tussen hen staat bekend als adenine- en Uracil-binding.

Het RNA is typisch een enkelstrengs nucleïnezuurstructuur die bestaat uit nucleotiden. Elke nucleotide is samengesteld uit een suiker met vijf koolstofatomen, een fosfaateenheid en een nucleobase. Er zijn vier nucleotiden aanwezig in RNA, zoals Adenine (A), Guanine (G), Cytosine (C) en Uracil (U). Wanneer zelf-complementaire basen in enkelstrengs RNA in nauwe interacties komen, vormen ze waterstofbruggen tussen hen. Dat is hoe een Adenine- en Uracil-binding zich vormt in de RNA-structuur. 

Adenine en Uracil binding

Adeninestructuur van Wikimedia Commons

Hoeveel waterstofbruggen vormen adenine en cytosine?

Adenine (A) en cytosine (C) zijn: stikstofbasen gevonden in zowel DNA als RNA structuur. 

Adenine (A) vormt waterstofachtige dubbele bindingen met Uracil (U) en Cytosine (C) vormt waterstofachtige drievoudige bindingen met Guanine (G) in RNA. 

Adenine (A) is een purinebase die complementair is met de pyrimidinebase Thymine (T) en Uracil (U). In RNA wordt Thymine vervangen door Uracil en daarom vormt Adenine (A) alleen waterstofbruggen met Uracil (U).

Cytosine (C) is een pyrimidinebase en complementair met purinebase Guanine (G). In beide nucleïnezuren vormt Cytosine (C) waterstofhoudende drievoudige bindingen met alleen Guanine (G).

7 beelden

Uracil-structuur van Wikimedia Commons

Bindt Uracil (U) met Adenine (A)?

In enkelstrengige RNA-structuren, wanneer zelf-complementaire basen in nauw contact komen, paren ze met elkaar en vormen waterstofbruggen.

Volgens de regels voor basenparen is Uracil een pyrimidinebase en bindt alleen met purinebase Adenine (A) in RNA-structuur. Maar in sommige gevallen blijkt dat uracil niet alleen bindt met adenine, maar ook met cytosine of andere. Afgezien van normale basenparing, wordt dit soort onregelmatige binding Wobble-baseparing genoemd.

2 beelden

Wobble basepair van Wikimedia Commons

Waarom binden adenine en uracil alleen in de RNA-structuur?

Adenine- en Uracil-binding is alleen aanwezig in de RNA-structuur en afwezig in de DNA-structuur.

Uracil (U) is de nucleobase die alleen in RNA wordt aangetroffen. In DNA wordt Uracil (U) vervangen door zijn gemethyleerde versie Thymine (T). Dat is de reden waarom tijdens basenparing Adenine in DNA maakt complementaire basenparen met Thymine (T) in plaats van Uracil (U). Terwijl in RNA Adenine een complementair basenpaar maakt met Uracil. Daarom is de Adenine- en Uracil-binding alleen aanwezig in de RNA-structuur.

Wat zijn de gemeenschappelijke nucleotiden gevormd door Adenine en Uracil in RNA?

De nucleobasen in een nucleïnezuurstructuur zijn typisch een deel van monomere nucleotide-eenheden.

Adenine (A) en Uracil (U) zijn beide afzonderlijk verbonden met een pentosesuiker en fosfaatgroepen, waardoor hun nucleotidestructuren worden gevormd. Adenine heeft drie verschillende nucleotidestructuren, zoals adenosinemonofosfaat (AMP), adenosinedifosfaat (ADP) en adenosinetrifosfaat (ATP). Uracil heeft ook drie verschillende nucleotidestructuren, zoals uridinemonofosfaat (UMP), uridinedifosfaat (UDP) en uridinetrifosfaat (UTP). 

Voor meer informatie over nucleotiden, lees ons artikel over: Voorbeelden van nucleotiden: gedetailleerde inzichten

Is de adenine- en uracil-binding minder stabiel dan de guanine-cytosine-binding?

Adenine - Uracil-binding en Guanine- Cytosinebinding brengen beide stabiliteit in een nucleïnezuurstructuur door hun waterstofbruggen.

Volgens de regels voor basenparen vormen de Adenine en Uracil waterstofhoudende dubbele bindingen daartussen. Guanine en Cytosine vormen onderling waterstofhoudende drievoudige bindingen. Omdat de guanine en cytosine meer waterstofbruggen tussen hen bevatten, is het stabieler en is de adenine- en uracil-binding minder stabiel.

Om deze reden is een GC-rijke nucleïnezuurstructuur stabieler. De meer GC-rijke sequenties verhogen het smeltpunt van het nucleïnezuur en houden de duplexstructuur effectiever vast.

Voor meer informatie over nucleotiden, lees ons artikel over: Nucleotiden in DNA-structuur: vergelijkende analyse over het geheel

Waarom is de Adenine- en Uracil-binding belangrijk voor de RNA-structuur?

De Adenine- en Uracil-binding in de RNA-structuur vervullen verschillende belangrijke rollen en verbeteren de efficiëntie van RNA-moleculen.

De Adenine- en Uracil-binding in enkelstrengs RNA verschaft een dubbelstrengs spiraalvormige structuur aan het nucleïnezuur. Het vouwt sommige delen van RNA. De interactie tussen de twee basen beïnvloedt de efficiëntie van het genetische codon en stimuleert het translatieproces via eiwitsynthese. De Adenine- en Uracil-binding brengt ook stabiliteit aan de RNA-structuur.

In RNA-moleculen maakt intramoleculaire vorming van waterstofbruggen het mogelijk om te vouwen en er een grote driedimensionale structuur in te bereiken. De basenparing beïnvloedt zowel de functies van mRNA's als tRNA's, stimuleert de aminozuurherkenning en eiwitsynthese processen grotendeels.

Lees voor meer informatie ons artikel over Adenine versus thymine: vergelijkende analyse

Als geheel kunnen we zeggen dat de binding van adenine en uracil erg belangrijk is in de RNA-structuur. Het is alleen aanwezig in RNA en verbetert de efficiëntie ervan. Beide adenine en Uracil vormen verschillende nucleotiden structuren en vergemakkelijken verschillende functies binnen de cel. Ik hoop dat de gegeven informatie in dit artikel nuttig voor u zal zijn.

Lees ook: