27 Nucleotidenvoorbeelden: gedetailleerde inzichten

Nucleotiden zijn de monomere basiseenheid van elk nucleïnezuur, bestaande uit een pentosesuikermolecuul, een van de vier stikstofhoudende basen en fosfaatgroepen. Hier bespreken we voorbeelden van nucleotiden en hun gerelateerde feiten.

Afhankelijk van het aantal fosfaatgroepen kunnen we de nucleotiden in drie groepen onderscheiden.

De nucleotidevoorbeelden die slechts uit één fosfaatgroep bestaan, zijn:

Adenosinemonofosfaat (AMP)

Adenosinemonofosfaat (AMP) is de monomere basiseenheid van RNA. Het is ook bekend als 5'-adenylzuur. Het molecuul is in wezen een ester van nucleoside adenosine en fosforzuur, bestaande uit één fosfaatgroep, een pentosegroep suiker ribose en stikstofbase adenineHet kan worden omgezet in ADP en ATP via het fosforyleringsproces. Door verschillende katabole routes kan het ook in het lichaam worden omgezet in urinezuur. 

Guanosinemonofosfaat (GMP)

Guanosinemonofosfaat (GMP) is een basische nucleotide monomere eenheid van RNA. Het wordt ook wel 5′-guanylzuur genoemd. GMP heeft een ribosesuikermolecuul met vijf koolstofatomen, een guanine-stikstofbase en slechts één fosfaatgroep erin. GMP produceert verschillende zouten, die kunnen worden gebruikt als voedseladditieven.

Cytidinemonofosfaat (CMP)

Cytidinemonofosfaat (CMP) is ook een ribonucleotide-monomeereenheid van RNA. CMP is een ester van fosforzuur met het nucleoside cytidine, bestaande uit een suikermolecuul met vijf koolstofribose, een cytosine met een stikstofbase en een fosfaatgroep. Het kan door fosforylering worden omgezet in cytidinedifosfaat (CDP) en cytidinetrifosfaat (CTP).

Uridinemonofosfaat (UMP)

Uridinemonofosfaat (UMP) is een ribonucleosidemonofosfaat, een van de basismonomeereenheden van RNA. Het is ook bekend als 5′-uridylzuur, bestaande uit een pentosesuikermolecuul (ribosesuiker), een stikstofhoudende base uracil en een fosfaatgroep. Het is een estermolecuul van nucleoside-uridine en fosforzuur. Het speelt een belangrijke rol bij de hersenontwikkeling van een persoon, het wordt meestal afgebroken in de lever en het maagdarmkanaal van een persoon. 

Cyclisch adenosinemonofosfaat (cAMP)

Cyclisch adenosinemonofosfaat (cAMP) is een derivaat van ATP. Het is een tweede boodschapper, speelt een zeer cruciale rol in celsignaleringsroutes.

Cyclisch guanosinemonofosfaat (cGMP)

Cyclisch guanosinemonofosfaat (cGMP) is een cyclisch derivaat van GTP, dat wordt gebruikt als een ionkanaalconductantieregulator. De cGTP is een veel voorkomende tweede boodschapper in de fototransductieprocedure in de ogen. Cellulaire apoptose wordt ook gereguleerd door cyclisch guanosinemonofosfaat.

Cyclisch cytidinemonofosfaat (cCMP)

Cyclisch cytidinemonofosfaat (cCMP) is een cyclisch nucleotide afgeleid van CTP of Cytidinetrifosfaat. Het dient ook als een cellulaire boodschapper in eukaryotische cellen, maar de meeste van haar activiteiten blijven onbekend. 

Cyclisch uridinemonofosfaat (cUMP)

Cyclisch uridinemonofosfaat (cUMP) is een cyclisch nucleotide met stikstofbase uracil. Het is ook een cellulair boodschappermolecuul in zoogdiercellen, maar de meeste van zijn activiteiten zijn nu nog onbekend.

Deoxyadenosinemonofosfaat (dAMP)

Deoxyadenosinemonofosfaat (dAMP) is een veelgebruikt derivaat van AMP, dat wordt gebruikt als een monomere eenheid van DNA. Het heeft een deoxyribosesuiker, een stikstofbase adenine en slechts één fosfaatgroep in zijn structuur.

Deoxyguanosinemonofosfaat (dGMP)

Deoxyguanosinemonofosfaat (dGMP) of deoxyguanylzuur is een algemeen derivaat van GMP. Het bevat een deoxyribosesuiker, een stikstofbase guanine en slechts één fosfaatgroep erin. Het wordt gebruikt als een basismonomeereenheid van DNA-synthese. 

Deoxycytidinemonofosfaat (dCMP)

Deoxycytidinemonofosfaat (dCMP) is een van de vier deoxyribosemonofosfaatnucleotiden die worden gebruikt bij de DNA-synthese. Het bevat een deoxyribosesuiker, een stikstofbase cytosine en slechts één fosfaatgroep in zijn structuur. Het is een derivaat van een gemeenschappelijk CMP-molecuul.

(Deoxy)thymidinemonofosfaat (dTMP)

(Deoxy)thymidinemonofosfaat (dTMP) is een monomere eenheid van DNA. Het bevat een deoxyribosesuiker, een stikstofbase thymine en een fosfaatgroep in zijn structuur. Het wordt alleen aangetroffen bij de deoxyribosesuiker en kan daarom niet worden gebruikt bij de RNA-synthese. Het is een ester van fosforzuur met een nucleoside thymidine. Het thymidinemonofosfaat bevat meestal niet het voorvoegsel "deoxy" met zijn naam. 

Nucleotide voorbeelden

Nucleotide Voorbeelden van Wikimedia Commons

De nucleotidevoorbeelden bestaande uit twee fosfaatgroepen zijn-

Adenosinedifosfaat (ADP)

Adenosinedifosfaat (ADP) is een nucleotide dat meestal wordt gebruikt om energie op te slaan of over te dragen. Het bevat een ribosesuiker met vijf koolstofatomen, een stikstofbase adenine en twee fosfaatgroepen. Het wordt geassocieerd met verschillende cellulaire activiteiten zoals ademhaling, activering van bloedplaatjes, enz. Het speelt een cruciale rol bij glycolyse, citroenzuur cyclus en oxidatieve fosforylering bij cellulaire ademhaling.

Guanosinedifosfaat (BBP)

Guanosinedifosfaat (GDP) is een nucleosidedifosfaatmolecuul, meestal essentieel in het signaaltransductiemechanisme van cellen. Het bestaat uit een ribosepentosesuiker, een stikstofhoudende base guanine en een pyrofosforgroep (twee fosfaatatomen). BBP kan worden omgezet in GTP.

Cytidinedifosfaat (CDP)

Cytidinedifosfaat (CDP) is een nucleosidedifosfaat, dat dient als dragermolecuul tijdens de synthese van fosfolipiden. Het heeft een ribose-pentosesuiker, een pyrimidinebase-cytosine en een pyrofosfaatgroep erin. Tijdens het syntheseproces van fosfolipiden speelt cytidinedifosfaat een belangrijke rol in: prokaryotisch en eukaryote cellen. 

Uridinedifosfaat (UDP)

Uridinedifosfaat (UDP) is een nucleosidedifosfaat met pyrimidinebase uracil, essentieel voor verschillende metabole en uitscheidingsactiviteiten. Het bevat een ribosesuiker met vijf koolstofatomen, een stikstofhoudende base uracil en pyrofosfaatgroep. In het glycogeneseproces dient uridinedifosfaat als een enzym en faciliteert verschillende metabolische processen.

Deoxyadenosinedifosfaat (dADP)

Deoxyadenosinedifosfaat (dADP) is een nucleosidedifosfaat afgeleid van gewoon ADP. Het bevat een deoxyribosesuiker, een purinebase adenine en een pyrofosfaatgroep. dADP is aanwezig in verschillende eukaryotische cellen en speelt een essentiële rol in het purinesyntheseproces.

Deoxyguanosinedifosfaat (dGDP)

Deoxyguanosinedifosfaat (dGDP) is een nucleosidedifosfaat met purinebase-guanine. Het is ook bekend als 2′-Deoxyguanosine 5′-difosfaat, omvat: een deoxyribosesuiker, een purinebase-guanine en twee fosfaateenheden in zijn structuur. Het is een metaboliet, die helpt bij het purinesyntheseproces.

Deoxycytidinedifosfaat (dCDP)

Deoxycytidinedifosfaat (dCDP) is een nucleoside met cytosine als basis van pyrimidine. Het is een veel voorkomende afgeleide van CTP. Het bevat een deoxyribosesuiker, een pyrimidinebase cytosine en twee fosfaateenheden. Het is ook bekend als 2′-deoxycytidine 5′-difosfaat. Het speelt enkele rollen als cellulaire metaboliet in mensen en gistcellen (saccharomyces cerevisiae).

(Deoxy)thymidinedifosfaat (dTDP) 

Dhh-trifosfaat (TTP). Het omvat een deoxyribosesuiker, een pyrimidinebase-thymine en twee fosfaateenheden in zijn structuur. In tegenstelling tot andere deoxyribonucleotiden, bevat het thymidinedifosfaat meestal niet het voorvoegsel "deoxy".

465px 229 Nucleotiden 01

Nucleotidevoorbeelden in DNA van: Wikimedia Commons

Om meer te weten te komen over het purinemetabolisme, lees ons artikel over: Purinemetabolisme | Belang in de menselijke fysiologie

De nucleotidevoorbeelden bestaande uit drie fosfaatgroepen zijn-

Adenosinetrifosfaat (ATP)

Adenosinetrifosfaat (ATP) is een nucleosidetrifosfaat, vaak de energievaluta van een cel genoemd. Het bestaat uit een ribose-pentosesuiker, een stikstofbase adenine en drie fosfaateenheden. Tijdens energieoverdracht wordt het omgezet in ADP en AMP door een hydrolyseproces. Het is een van de belangrijkste nucleotiden in elk levend organisme, betrokken bij verschillende activiteiten zoals intracellulaire signaaltransductie, extracellulaire signalering, aminozuuractivering, nucleïnezuursynthese, enz.

Guanosinetrifosfaat (GTP)

Guanosinetrifosfaat (GTP) is een nucleosidetrifosfaat met purinebase-guanine. Het dient als een energiebron van cellen en stimuleert ook signaaltransductieroutes. Het bevat een ribosepentosesuiker, een stikstofhoudende base guanine en drie fosfaateenheden. Het is een zeer essentieel nucleotide dat wordt gebruikt in het RNA-transcriptieproces. Het speelt ook een belangrijke rol in verschillende metabole processen zoals gluconeogenese, eiwitsynthese, enz.

Cytidinetrifosfaat (CTP)

Cytidinetrifosfaat (CTP) is een nucleosidetrifosfaat, dat wil zeggen: het heeft een ribose-pentosesuikergroep, een pyrimidinebase-cytosine en drie fosfaatgroepen. Net als ATP en GTP dient het ook als energiebron voor cellen. Tijdens glycerofosfolipiden en glycosylering van eiwitten werkt het CTP als een co-enzym in verschillende cellen.

Uridinetrifosfaat (UTP)

Uridinetrifosfaat (UTP) is een nucleosidetrifosfaat met pyrimidinebase uracil. Het is samengesteld uit een ribosesuiker met vijf koolstofatomen, een stikstofbase uracil en drie fosfaateenheden in zijn structuur. Het wordt ook gebruikt als energiebron van cellen, betrokken bij celsignalering en eiwitactiveringsprocessen. Het wordt meestal gebruikt bij RNA-transcriptie.

Deoxyadenosinetrifosfaat (dATP)

Deoxyadenosinetrifosfaat (dATP) is een nucleosidetrifosfaat, meestal gebruikt als energievaluta van een cel. Het bestaat uit een deoxyribosesuiker, een stikstofbase adenine en drie fosfaateenheden. Het speelt een cruciale rol in de DNA-synthese. Het dient als een energiebron van cellen en draagt ​​energie over tijdens verschillende metabolische processen.

Deoxyguanosinetrifosfaat (dGTP)

Deoxyguanosinetrifosfaat (dGTP) is een nucleosidetrifosfaat met purinebase-guanine. Het is samengesteld uit een deoxyribosesuiker, een purinebase-guanine en drie fosfaateenheden. Het wordt veel gebruikt in polymerasekettingreactietechnieken.

Deoxycytidinetrifosfaat (dCTP)

Deoxycytidinetrifosfaat (dCTP) is een nucleosidetrifosfaat met stikstofhoudende cytosine. Het dient ook als een energiebron van cellen, waarbij energie vrijkomt tijdens verschillende metabolische processen door middel van hydrolyse.

(Deoxy)thymidinetrifosfaat (dTTP)

Thymidinetrifosfaat (TTP) of dTTP is een nucleosidetrifosfaat met pyrimidinebasethymine. Het bestaat uit een deoxyribosesuiker, een stikstofbase thymine en drie fosfaateenheden. Het wordt meestal gebruikt tijdens het in vivo syntheseproces van DNA, terwijl de meeste toepassingen ervan tot nu toe onbekend blijven.

Uracil wordt alleen gevonden in RNA, van alle nucleiotide-voorbeelden en Thymine wordt alleen gevonden in DNA van alle nucleiotide-voorbeelden.

Lees ons artikel over Purine | . voor meer informatie over purines Zijn fundamentele structuur

Als geheel kunnen we zeggen dat nucleotiden het belangrijkste deel van een cel zijn. Hier beschrijven we de nucleotide-voorbeelden en over hun uitputtende kenmerken. Ik hoop dat dit artikel nuttig voor je zal zijn.

Lees ook: